三九九正集团是三九企业集团的延展企业。2001年，根据三九企业集团中长远企划目标以及党委的指示，精选出一支善于创新、敢于拼搏、立志弘扬中华传统医药的精英团队，以立足香港、背靠内陆、面向海外的战略部署，于同年正式组建“三九九正集团有限公司”，并在香港正式挂牌运营。为了实现拓展欧洲、澳洲、北美、西亚及独联体等战略目标市场，相继在香港设立了致富国际有限公司及三九健博士专门店有限公司等两大企业，并开设六间品牌旗舰店。
三九药业集团和华润三九药业集团不是同一家公司。但有渊源。1999年三九集团，三九药业股份有限公司等五家公司发起设立股份制公司。2000年3月9日在深交所挂牌上市，代码000999，筒称三九药业。2008年正式进入华润集团，公司名称变更为华润三九医药股份有限公司，简称华润三九。
阜阳三九药业和华润三九药业集团没什么关系。
安徽三九药业有限公司于2016年04月26日成立。法定代表人胡寅道,公司经营范围包括：中药材的分拣与销售；农副产品购销；一类医疗器械、二类医疗器械购销；保健食品的生产销售，生物科技技术开发与咨询服务，糖果制品、固体饮料、代用茶生产销售等。
三九集团组建于1991年12月，由原国家经贸委、中国人民解放军总后勤部批准成立，其前身是总后勤部所属企业深圳南方制药厂。
集团以医药为主营业务，以中药制造为核心，同时还涉及工程、房地产等领域。目前，集团拥有上市公司“三九医药”以及20多家通过GMP认证的医药生产企业。
拥有近1000个中西药产品和覆盖全国的医药销售网络。并已建成国家级企业技术中心，部分项目列入国家“863”计划，曾多次获国家及省部级技术进步奖项。
2007年12月，三九企业集团经国务院批准并入华润（集团）有限公司成为其全资子企业，从此从国务院国资委履行出资人职责的央企退出。
三九药业有限公司属于华润集团控股公司。
三九医药股份有限公司（简称“三九医药”）是大型国有控股医药上市公司，前身为深圳南方制药厂。1999年4月21日，由三九企业集团、三九药业股份有限公司等5家公司发起设立股份制公司。2000年3月9日在深圳证券交易所挂牌上市，股票代码000999。
华润集团是大型囯有控股医药集团，华润三九是其控股子公司。
三九胃泰、999感冒灵、999皮炎平、正天丸、参附注射液、新泰林（注射用五水头孢唑啉钠）等。
三九医药股份有限公司（简称“三九医药”）是大型国有控股医药上市公司，前身为深圳南方制药厂。1999年4月21日，由三九企业集团、三九药业股份有限公司等5家公司发起设立股份制公司。2000年3月9日在深圳证券交易所挂牌上市，股票代码000999。
三九医药股份有限公司主要从事医药产品的研发、生产、销售及相关健康服务。公司以OTC（非处方药）、中药处方药、免煎中药、抗生素及普药为四大制药业务模块，辅以包装印刷、医疗服务等相关业务。
三九集团是国有控股医药类股份上市公司，代码000999。总部地址：深圳罗湖银湖路口。创立于1999年四月，2000年三月深圳证券交易所上市。公司全称：华润三九医药股份有限公司。主要从事医药产品的研发、生产、销售及级相关健康服务。公司以OTC、中药处方药、免煎中药、抗生素及普药为四大制药业务模块。
不属于三九集团，大股东是国鲁控股有限公司，持股比例100%，是黑龙江省物资厅旗下公司。
中盛交通统筹服务有限公司是国家正式批设的综合性服务公司。集团旗下有16家物流运输公司，已和全国400余家大型物流运输企业达成战略合作协议，服务覆盖城市60多个,主要分布在山东省、安徽省、四川省等地区。
三九企业集团是原国务院国有资产监督管理委员会直接管理的国有大型中央企业。集团以医药为主营业务，以中药制造为核心，同时还涉及工程、房地产等领域。国有大型中央企业。
集团组建于1991年12月，由原国家经贸委、中国人民解放军总后勤部批准成立，其前身是总后勤部所属企业深圳南方制药厂。
经报国务院批准，2007年12月，三九企业集团并入华润（集团）有限公司成为其全资子企业。